第二次世界大戰前夕一名普通的陸軍士兵（龜梨和也 飾）因幫助同伴而毆打長官隨后被軍事法庭判處死刑關鍵時刻名叫結城（伊勢谷友介 飾）的神秘男子突然出現并將之吸納進專門培養間諜的秘密部門——D機關歷經層層考驗青年終于得到第一項任務不久前某猶太科學家遭到暗殺而他記載著最新式武器設計圖的黑色筆記據說落入美國大使埃內斯特·格雷厄姆（Richard Moss 飾）手中青年化名嘉藤次郎來到了被稱為魔都的城市伺機盜出筆記與此同時英、蘇、德等國的特工也聞風而動頂峰的間諜大戰即將展開…… 　　本片根據柳廣司的同名系列小說改編