公元2035年人類被12只猴子軍研制的一種病毒侵襲大部分人類都在這場病毒災難中死亡只有少數人僥幸逃生但也只能在陰暗的地下茍且偷生 　　科學家們決定派人穿越時光回到1996年追查12只猴子軍的來歷囚徒詹姆斯·科爾(布魯斯·威利斯 Bruce Willis 飾)被 挑選為志愿者陰差陽錯科爾回到了1990年當他向當時的人們描述未來的那場大災難時被當作精神病捉了起來并被醫生凱瑟琳·雪莉（瑪德琳·斯通 Madeleine Stowe 飾）診斷為精神分裂癥科爾在病友杰弗里·戈因斯幫助下逃脫回到了未來因為沒查清12只猴子軍的來歷科爾再次被派回了1996年 　　科爾這次發現了12只猴子軍的起源地在費城他找到了醫生凱瑟琳二人一起展開了追查12只猴子軍的冒險之旅!